Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SF3A2Q15428 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SF3A2Q15428 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3A2Q15428 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A2Q15428 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3A2Q15428 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3A2Q15428 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3A2Q15428 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3A2Q15428 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3A2Q15428 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3A2Q15428 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3A2Q15428 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF3A2Q15428 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3A2Q15428 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SF3A2Q15428 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF3A2Q15428 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms