Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDGFRLQ15198 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDGFRLQ15198 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFRLQ15198 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFRLQ15198 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFRLQ15198 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFRLQ15198 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFRLQ15198 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFRLQ15198 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFRLQ15198 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFRLQ15198 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFRLQ15198 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFRLQ15198 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFRLQ15198 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFRLQ15198 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFRLQ15198 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PDGFRLQ15198 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFRLQ15198 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFRLQ15198 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFRLQ15198 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFRLQ15198 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRLQ15198 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRLQ15198 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRLQ15198 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRLQ15198 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRLQ15198 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRLQ15198 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFRLQ15198 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFRLQ15198 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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