Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ARHGEF6Q15052 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ARHGEF6Q15052 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARHGEF6Q15052 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ARHGEF6Q15052 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF6Q15052 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ARHGEF6Q15052 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF6Q15052 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ARHGEF6Q15052 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF6Q15052 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ARHGEF6Q15052 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ARHGEF6Q15052 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF6Q15052 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ARHGEF6Q15052 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF6Q15052 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ARHGEF6Q15052 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ARHGEF6Q15052 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ARHGEF6Q15052 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARHGEF6Q15052 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARHGEF6Q15052 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ARHGEF6Q15052 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF6Q15052 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF6Q15052 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ARHGEF6Q15052 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARHGEF6Q15052 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARHGEF6Q15052 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARHGEF6Q15052 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF6Q15052 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARHGEF6Q15052 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARHGEF6Q15052 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARHGEF6Q15052 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARHGEF6Q15052 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARHGEF6Q15052 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARHGEF6Q15052 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARHGEF6Q15052 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARHGEF6Q15052 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARHGEF6Q15052 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARHGEF6Q15052 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARHGEF6Q15052 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARHGEF6Q15052 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARHGEF6Q15052 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ARHGEF6Q15052 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF6Q15052 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF6Q15052 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF6Q15052 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF6Q15052 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF6Q15052 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF6Q15052 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF6Q15052 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF6Q15052 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF6Q15052 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF6Q15052 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF6Q15052 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF6Q15052 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF6Q15052 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF6Q15052 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ARHGEF6Q15052 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF6Q15052 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ARHGEF6Q15052 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF6Q15052 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF6Q15052 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF6Q15052 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARHGEF6Q15052 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARHGEF6Q15052 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARHGEF6Q15052 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARHGEF6Q15052 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARHGEF6Q15052 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ARHGEF6Q15052 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms