Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NCAPHQ15003 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCAPHQ15003 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCAPHQ15003 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPHQ15003 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPHQ15003 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPHQ15003 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAPHQ15003 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPHQ15003 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCAPHQ15003 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAPHQ15003 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCAPHQ15003 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NCAPHQ15003 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCAPHQ15003 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAPHQ15003 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPHQ15003 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPHQ15003 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPHQ15003 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPHQ15003 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCAPHQ15003 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCAPHQ15003 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCAPHQ15003 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPHQ15003 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NCAPHQ15003 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCAPHQ15003 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCAPHQ15003 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPHQ15003 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAPHQ15003 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCAPHQ15003 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCAPHQ15003 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NCAPHQ15003 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCAPHQ15003 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCAPHQ15003 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCAPHQ15003 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCAPHQ15003 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCAPHQ15003 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCAPHQ15003 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCAPHQ15003 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCAPHQ15003 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCAPHQ15003 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCAPHQ15003 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCAPHQ15003 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCAPHQ15003 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCAPHQ15003 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCAPHQ15003 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCAPHQ15003 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NCAPHQ15003 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCAPHQ15003 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCAPHQ15003 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCAPHQ15003 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCAPHQ15003 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAPHQ15003 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
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