Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMC1AQ14683 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMC1AQ14683 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC1AQ14683 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMC1AQ14683 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SMC1AQ14683 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC1AQ14683 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms