Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF3Q14653 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF3Q14653 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF3Q14653 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF3Q14653 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF3Q14653 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF3Q14653 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF3Q14653 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF3Q14653 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF3Q14653 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF3Q14653 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF3Q14653 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF3Q14653 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF3Q14653 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF3Q14653 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRF3Q14653 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF3Q14653 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF3Q14653 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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