Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBX1Q14549 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBX1Q14549 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBX1Q14549 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBX1Q14549 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GBX1Q14549 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GBX1Q14549 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GBX1Q14549 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GBX1Q14549 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GBX1Q14549 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GBX1Q14549 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBX1Q14549 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GBX1Q14549 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBX1Q14549 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBX1Q14549 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBX1Q14549 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GBX1Q14549 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GBX1Q14549 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
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