Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SCARF1Q14162 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCARF1Q14162 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SCARF1Q14162 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCARF1Q14162 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SCARF1Q14162 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCARF1Q14162 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCARF1Q14162 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCARF1Q14162 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCARF1Q14162 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCARF1Q14162 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCARF1Q14162 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SCARF1Q14162 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SCARF1Q14162 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SCARF1Q14162 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
SCARF1Q14162 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SCARF1Q14162 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SCARF1Q14162 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SCARF1Q14162 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCARF1Q14162 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCARF1Q14162 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SCARF1Q14162 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCARF1Q14162 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SCARF1Q14162 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCARF1Q14162 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SCARF1Q14162 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SCARF1Q14162 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
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