Protein–RNA interactions for Protein: Q14152

EIF3A, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3AQ14152 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.28■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
EIF3AQ14152 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
EIF3AQ14152 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EIF3AQ14152 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.11■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.09■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
EIF3AQ14152 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
EIF3AQ14152 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
EIF3AQ14152 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
EIF3AQ14152 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
EIF3AQ14152 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
EIF3AQ14152 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
EIF3AQ14152 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
EIF3AQ14152 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
EIF3AQ14152 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
EIF3AQ14152 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
EIF3AQ14152 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
EIF3AQ14152 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
EIF3AQ14152 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
EIF3AQ14152 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
EIF3AQ14152 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
EIF3AQ14152 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
EIF3AQ14152 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
EIF3AQ14152 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
EIF3AQ14152 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
EIF3AQ14152 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
EIF3AQ14152 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
EIF3AQ14152 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
EIF3AQ14152 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
EIF3AQ14152 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
EIF3AQ14152 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
EIF3AQ14152 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
EIF3AQ14152 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms