Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX1Q13596 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX1Q13596 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX1Q13596 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX1Q13596 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX1Q13596 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX1Q13596 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX1Q13596 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX1Q13596 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX1Q13596 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX1Q13596 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX1Q13596 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX1Q13596 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX1Q13596 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX1Q13596 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNX1Q13596 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX1Q13596 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX1Q13596 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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