Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF4BQ13523 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRPF4BQ13523 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF4BQ13523 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF4BQ13523 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF4BQ13523 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRPF4BQ13523 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRPF4BQ13523 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
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