Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRSQ13332 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRSQ13332 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRSQ13332 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRSQ13332 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRSQ13332 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRSQ13332 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRSQ13332 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRSQ13332 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRSQ13332 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRSQ13332 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRSQ13332 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRSQ13332 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRSQ13332 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRSQ13332 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRSQ13332 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRSQ13332 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRSQ13332 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRSQ13332 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRSQ13332 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRSQ13332 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRSQ13332 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRSQ13332 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRSQ13332 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRSQ13332 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRSQ13332 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRSQ13332 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRSQ13332 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRSQ13332 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRSQ13332 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRSQ13332 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRSQ13332 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRSQ13332 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRSQ13332 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRSQ13332 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRSQ13332 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRSQ13332 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRSQ13332 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRSQ13332 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRSQ13332 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRSQ13332 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRSQ13332 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRSQ13332 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRSQ13332 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRSQ13332 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRSQ13332 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRSQ13332 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRSQ13332 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRSQ13332 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRSQ13332 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRSQ13332 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRSQ13332 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRSQ13332 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRSQ13332 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRSQ13332 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRSQ13332 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRSQ13332 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRSQ13332 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRSQ13332 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRSQ13332 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRSQ13332 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRSQ13332 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRSQ13332 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRSQ13332 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRSQ13332 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRSQ13332 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRSQ13332 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
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