Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLN3Q13286 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLN3Q13286 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLN3Q13286 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLN3Q13286 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLN3Q13286 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLN3Q13286 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLN3Q13286 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLN3Q13286 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLN3Q13286 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLN3Q13286 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLN3Q13286 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLN3Q13286 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLN3Q13286 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLN3Q13286 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLN3Q13286 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLN3Q13286 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLN3Q13286 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLN3Q13286 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLN3Q13286 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLN3Q13286 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLN3Q13286 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLN3Q13286 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLN3Q13286 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLN3Q13286 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLN3Q13286 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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