Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ERCC8Q13216 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERCC8Q13216 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERCC8Q13216 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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ERCC8Q13216 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERCC8Q13216 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERCC8Q13216 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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