Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL28Q13084 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL28Q13084 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL28Q13084 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPL28Q13084 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL28Q13084 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL28Q13084 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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