Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK2Q13002 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK2Q13002 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK2Q13002 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK2Q13002 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK2Q13002 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIK2Q13002 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIK2Q13002 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
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