Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.432e-20■■■■□ 25.4
GRSF1Q12849 RANBP2-202ENST00000425282 367 ntTSL 519.69■□□□□ 0.743e-9■■■■□ 25.3
GRSF1Q12849 RANBP2-205ENST00000629728 156 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.853e-9■■■■□ 25.3
GRSF1Q12849 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.743e-9■■■■□ 25.3
GRSF1Q12849 ZGPAT-207ENST00000468235 594 ntTSL 1 (best)19.62■□□□□ 0.732e-6■■■■□ 25.2
GRSF1Q12849 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -05e-17■■■■□ 25.2
GRSF1Q12849 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.295e-17■■■■□ 25.2
GRSF1Q12849 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.365e-17■■■■□ 25.2
GRSF1Q12849 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.45e-17■■■■□ 25.2
GRSF1Q12849 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.475e-17■■■■□ 25.2
GRSF1Q12849 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.65e-17■■■■□ 25.2
GRSF1Q12849 SHANK2-220ENST00000608988 1879 ntTSL 522.49■■□□□ 1.192e-6■■■■□ 25
GRSF1Q12849 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 25
GRSF1Q12849 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.028e-7■■■■□ 25
GRSF1Q12849 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.158e-7■■■■□ 25
GRSF1Q12849 FKBP9-205ENST00000468510 653 ntTSL 212.99□□□□□ -0.338e-7■■■■□ 25
GRSF1Q12849 FKBP9-202ENST00000418354 780 ntTSL 212□□□□□ -0.498e-7■■■■□ 25
GRSF1Q12849 FKBP9-212ENST00000490776 2699 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.728e-7■■■■□ 25
GRSF1Q12849 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.953e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.733e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 GMDS-201ENST00000380805 1743 ntTSL 218.43■□□□□ 0.543e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 PACSIN2-210ENST00000453643 818 ntTSL 517.02■□□□□ 0.323e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.013e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 PACSIN2-208ENST00000445706 511 ntTSL 512.89□□□□□ -0.353e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.483e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.493e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 IGF1R-216ENST00000560972 310 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.493e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 GMDS-210ENST00000533279 817 ntTSL 511.65□□□□□ -0.543e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.593e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.63e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.663e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.683e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.683e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.693e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.733e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.763e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.053e-7■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 219.49■□□□□ 0.713e-28■■■■□ 24.8
GRSF1Q12849 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.137e-7■■■■□ 24.5
GRSF1Q12849 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.057e-7■■■■□ 24.5
GRSF1Q12849 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.327e-7■■■■□ 24.5
GRSF1Q12849 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.357e-7■■■■□ 24.5
GRSF1Q12849 RAB40C-211ENST00000568586 648 ntTSL 231.05■■■□□ 2.561e-7■■■■□ 24.1
GRSF1Q12849 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.571e-7■■■■□ 24.1
GRSF1Q12849 RAB40C-212ENST00000569575 692 ntTSL 224.04■■□□□ 1.441e-7■■■■□ 24.1
GRSF1Q12849 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.431e-7■■■■□ 24.1
GRSF1Q12849 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.441e-7■■■■□ 24.1
GRSF1Q12849 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.431e-7■■■■□ 24.1
GRSF1Q12849 RAB40C-210ENST00000566290 753 ntTSL 316.54■□□□□ 0.241e-7■■■■□ 24.1
GRSF1Q12849 ATXN7L3-210ENST00000591295 3017 ntTSL 512.88□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 24
GRSF1Q12849 ATXN7L3-202ENST00000454077 3523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 24
GRSF1Q12849 ATXN7L3-201ENST00000389384 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 24
GRSF1Q12849 BISPR-205ENST00000634731 571 ntTSL 325.67■■□□□ 1.77e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 BISPR-213ENST00000635572 647 ntTSL 420.84■□□□□ 0.937e-13■■■■□ 24
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GRSF1Q12849 CARHSP1-204ENST00000562586 578 ntTSL 217.07■□□□□ 0.325e-7■■■■□ 24
GRSF1Q12849 AL391244.1-203ENST00000418833 2196 ntTSL 217.04■□□□□ 0.325e-7■■■■□ 24
GRSF1Q12849 AL391244.1-202ENST00000444362 1747 ntTSL 1 (best)16.79■□□□□ 0.285e-7■■■■□ 24
GRSF1Q12849 MVB12A-210ENST00000529490 480 ntTSL 416.02■□□□□ 0.167e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.135e-7■■■■□ 24
GRSF1Q12849 SNAPC4-202ENST00000637388 1398 ntTSL 515.66■□□□□ 0.15e-7■■■■□ 24
GRSF1Q12849 CARHSP1-214ENST00000569572 578 ntTSL 315.07■□□□□ 05e-7■■■■□ 24
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GRSF1Q12849 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.065e-7■■■■□ 24
GRSF1Q12849 BISPR-208ENST00000635060 1059 ntTSL 514.32□□□□□ -0.127e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 BISPR-212ENST00000635536 989 ntTSL 214.03□□□□□ -0.167e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 BISPR-203ENST00000634577 563 ntTSL 414.03□□□□□ -0.167e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 BISPR-210ENST00000635339 493 ntTSL 314.03□□□□□ -0.167e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 MVB12A-208ENST00000528911 820 ntTSL 512.95□□□□□ -0.347e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.357e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 BISPR-211ENST00000635435 1505 ntTSL 1 (best)12.71□□□□□ -0.387e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.445e-7■■■■□ 24
GRSF1Q12849 MVB12A-205ENST00000528604 656 ntTSL 312.21□□□□□ -0.457e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 BISPR-202ENST00000634568 603 ntTSL 511.88□□□□□ -0.517e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 BISPR-206ENST00000634813 456 ntTSL 411.46□□□□□ -0.577e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 BISPR-209ENST00000635176 1041 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.677e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 SNHG14-210ENST00000546682 8842 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.835e-7■■■■□ 24
GRSF1Q12849 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.065e-7■■■■□ 24
GRSF1Q12849 BISPR-207ENST00000634942 376 ntTSL 53.29□□□□□ -1.887e-13■■■■□ 24
GRSF1Q12849 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.122e-9■■■■□ 23.8
GRSF1Q12849 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.443e-7■■■■□ 23.7
GRSF1Q12849 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.033e-7■■■■□ 23.7
GRSF1Q12849 MDC1-201ENST00000376406 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 23.7
GRSF1Q12849 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.025e-17■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 NFKBIL1-202ENST00000376146 1411 ntTSL 420.3■□□□□ 0.845e-17■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.845e-17■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.191e-9■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.546e-8■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.336e-8■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.293e-28■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 BCAR1-213ENST00000563323 558 ntTSL 321.72■■□□□ 1.071e-7■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-7■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 BCAR1-215ENST00000564028 558 ntTSL 417.03■□□□□ 0.321e-7■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.191e-7■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 BCAR1-221ENST00000569006 574 ntTSL 415.73■□□□□ 0.111e-7■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 BCAR1-220ENST00000568864 556 ntTSL 415.43■□□□□ 0.061e-7■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.021e-7■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.021e-7■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.131e-7■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 BCAR1-211ENST00000562556 4659 ntTSL 212.98□□□□□ -0.331e-7■■■■□ 23.6
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