Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF5AQ12840 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF5AQ12840 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF5AQ12840 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF5AQ12840 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF5AQ12840 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF5AQ12840 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF5AQ12840 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF5AQ12840 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF5AQ12840 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF5AQ12840 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF5AQ12840 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF5AQ12840 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF5AQ12840 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF5AQ12840 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF5AQ12840 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF5AQ12840 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KIF5AQ12840 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIF5AQ12840 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF5AQ12840 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF5AQ12840 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIF5AQ12840 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIF5AQ12840 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms