Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNMA1Q12791 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNMA1Q12791 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNMA1Q12791 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNMA1Q12791 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNMA1Q12791 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNMA1Q12791 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNMA1Q12791 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNMA1Q12791 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
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KCNMA1Q12791 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNMA1Q12791 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNMA1Q12791 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNMA1Q12791 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNMA1Q12791 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNMA1Q12791 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNMA1Q12791 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNMA1Q12791 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNMA1Q12791 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNMA1Q12791 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNMA1Q12791 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNMA1Q12791 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNMA1Q12791 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNMA1Q12791 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNMA1Q12791 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNMA1Q12791 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNMA1Q12791 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
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KCNMA1Q12791 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
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KCNMA1Q12791 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
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KCNMA1Q12791 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNMA1Q12791 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNMA1Q12791 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNMA1Q12791 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNMA1Q12791 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
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KCNMA1Q12791 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNMA1Q12791 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNMA1Q12791 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNMA1Q12791 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNMA1Q12791 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
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KCNMA1Q12791 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNMA1Q12791 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNMA1Q12791 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNMA1Q12791 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNMA1Q12791 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNMA1Q12791 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
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