Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFFO1Q0D2I5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFFO1Q0D2I5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFFO1Q0D2I5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFFO1Q0D2I5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFFO1Q0D2I5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFFO1Q0D2I5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms