Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPOCK1Q08629 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPOCK1Q08629 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPOCK1Q08629 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCK1Q08629 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCK1Q08629 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms