Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK18Q07002 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK18Q07002 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK18Q07002 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDK18Q07002 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK18Q07002 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK18Q07002 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDK18Q07002 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDK18Q07002 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK18Q07002 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK18Q07002 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDK18Q07002 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK18Q07002 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK18Q07002 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDK18Q07002 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDK18Q07002 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK18Q07002 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDK18Q07002 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK18Q07002 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms