Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PSME1Q06323 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PSME1Q06323 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PSME1Q06323 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PSME1Q06323 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PSME1Q06323 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PSME1Q06323 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PSME1Q06323 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PSME1Q06323 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PSME1Q06323 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PSME1Q06323 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PSME1Q06323 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PSME1Q06323 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PSME1Q06323 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PSME1Q06323 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PSME1Q06323 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PSME1Q06323 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PSME1Q06323 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PSME1Q06323 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PSME1Q06323 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PSME1Q06323 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PSME1Q06323 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PSME1Q06323 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PSME1Q06323 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PSME1Q06323 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PSME1Q06323 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PSME1Q06323 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PSME1Q06323 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PSME1Q06323 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PSME1Q06323 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PSME1Q06323 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PSME1Q06323 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PSME1Q06323 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PSME1Q06323 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PSME1Q06323 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PSME1Q06323 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
PSME1Q06323 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PSME1Q06323 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PSME1Q06323 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PSME1Q06323 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PSME1Q06323 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PSME1Q06323 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PSME1Q06323 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PSME1Q06323 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PSME1Q06323 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PSME1Q06323 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PSME1Q06323 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PSME1Q06323 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PSME1Q06323 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PSME1Q06323 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PSME1Q06323 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PSME1Q06323 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PSME1Q06323 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PSME1Q06323 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms