Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB3Q05901 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB3Q05901 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB3Q05901 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB3Q05901 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB3Q05901 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB3Q05901 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB3Q05901 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNB3Q05901 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNB3Q05901 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNB3Q05901 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNB3Q05901 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB3Q05901 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB3Q05901 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNB3Q05901 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNB3Q05901 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNB3Q05901 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB3Q05901 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB3Q05901 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB3Q05901 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB3Q05901 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB3Q05901 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB3Q05901 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB3Q05901 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB3Q05901 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHRNB3Q05901 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHRNB3Q05901 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNB3Q05901 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB3Q05901 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNB3Q05901 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms