Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPN12Q05209 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPN12Q05209 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPN12Q05209 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPN12Q05209 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPN12Q05209 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPN12Q05209 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPN12Q05209 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPN12Q05209 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPN12Q05209 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPN12Q05209 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPN12Q05209 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPN12Q05209 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPN12Q05209 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPN12Q05209 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPN12Q05209 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPN12Q05209 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPN12Q05209 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPN12Q05209 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PTPN12Q05209 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPN12Q05209 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPN12Q05209 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPN12Q05209 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPN12Q05209 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPN12Q05209 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPN12Q05209 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PTPN12Q05209 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PTPN12Q05209 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPN12Q05209 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PTPN12Q05209 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPN12Q05209 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms