Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TLE4Q04727 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLE4Q04727 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLE4Q04727 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLE4Q04727 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLE4Q04727 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms