Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT17Q04695 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT17Q04695 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT17Q04695 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT17Q04695 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT17Q04695 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT17Q04695 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT17Q04695 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT17Q04695 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT17Q04695 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT17Q04695 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT17Q04695 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT17Q04695 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT17Q04695 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT17Q04695 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT17Q04695 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT17Q04695 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT17Q04695 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT17Q04695 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT17Q04695 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT17Q04695 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT17Q04695 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT17Q04695 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT17Q04695 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms