Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPCQ03188 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPCQ03188 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPCQ03188 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CENPCQ03188 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPCQ03188 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPCQ03188 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPCQ03188 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms