Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGFBR3Q03167 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR3Q03167 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFBR3Q03167 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFBR3Q03167 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR3Q03167 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR3Q03167 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR3Q03167 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR3Q03167 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR3Q03167 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR3Q03167 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR3Q03167 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR3Q03167 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TGFBR3Q03167 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TGFBR3Q03167 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms