Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP27A1Q02318 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP27A1Q02318 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP27A1Q02318 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP27A1Q02318 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP27A1Q02318 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP27A1Q02318 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP27A1Q02318 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP27A1Q02318 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP27A1Q02318 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP27A1Q02318 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP27A1Q02318 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP27A1Q02318 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP27A1Q02318 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP27A1Q02318 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP27A1Q02318 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms