Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPEQ02224 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPEQ02224 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPEQ02224 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPEQ02224 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPEQ02224 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPEQ02224 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPEQ02224 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPEQ02224 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPEQ02224 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPEQ02224 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPEQ02224 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPEQ02224 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPEQ02224 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPEQ02224 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms