Protein–RNA interactions for Protein: Q01813

PFKP, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKPQ01813 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PFKPQ01813 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PFKPQ01813 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PFKPQ01813 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PFKPQ01813 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PFKPQ01813 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PFKPQ01813 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PFKPQ01813 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PFKPQ01813 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PFKPQ01813 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFKPQ01813 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PFKPQ01813 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PFKPQ01813 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PFKPQ01813 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PFKPQ01813 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PFKPQ01813 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKPQ01813 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms