Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFITM3Q01628 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFITM3Q01628 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFITM3Q01628 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFITM3Q01628 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFITM3Q01628 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFITM3Q01628 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFITM3Q01628 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFITM3Q01628 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFITM3Q01628 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFITM3Q01628 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFITM3Q01628 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFITM3Q01628 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFITM3Q01628 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFITM3Q01628 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFITM3Q01628 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFITM3Q01628 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms