Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HMGCS1Q01581 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGCS1Q01581 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGCS1Q01581 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGCS1Q01581 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGCS1Q01581 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGCS1Q01581 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGCS1Q01581 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGCS1Q01581 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGCS1Q01581 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGCS1Q01581 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGCS1Q01581 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGCS1Q01581 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HMGCS1Q01581 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGCS1Q01581 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGCS1Q01581 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGCS1Q01581 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms