Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEFA6Q01524 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEFA6Q01524 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DEFA6Q01524 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEFA6Q01524 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEFA6Q01524 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DEFA6Q01524 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms