Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
B4GALNT1Q00973 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4GALNT1Q00973 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
B4GALNT1Q00973 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
B4GALNT1Q00973 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
B4GALNT1Q00973 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms