Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDKL1Q00532 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKL1Q00532 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKL1Q00532 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL1Q00532 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL1Q00532 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL1Q00532 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.3 ms