Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP2R2BQ00005 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP2R2BQ00005 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP2R2BQ00005 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP2R2BQ00005 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP2R2BQ00005 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPP2R2BQ00005 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP2R2BQ00005 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP2R2BQ00005 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP2R2BQ00005 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP2R2BQ00005 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP2R2BQ00005 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP2R2BQ00005 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms