Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MRPS9P82933 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MRPS9P82933 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MRPS9P82933 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MRPS9P82933 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MRPS9P82933 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MRPS9P82933 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MRPS9P82933 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MRPS9P82933 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MRPS9P82933 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MRPS9P82933 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MRPS9P82933 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MRPS9P82933 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MRPS9P82933 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MRPS9P82933 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MRPS9P82933 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MRPS9P82933 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MRPS9P82933 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MRPS9P82933 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRPS9P82933 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MRPS9P82933 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MRPS9P82933 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
MRPS9P82933 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MRPS9P82933 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRPS9P82933 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRPS9P82933 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRPS9P82933 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MRPS9P82933 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MRPS9P82933 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MRPS9P82933 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MRPS9P82933 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MRPS9P82933 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MRPS9P82933 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MRPS9P82933 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MRPS9P82933 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MRPS9P82933 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MRPS9P82933 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MRPS9P82933 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MRPS9P82933 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MRPS9P82933 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms