Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPC5P78333 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPC5P78333 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPC5P78333 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPC5P78333 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPC5P78333 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPC5P78333 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GPC5P78333 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPC5P78333 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPC5P78333 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPC5P78333 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPC5P78333 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPC5P78333 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPC5P78333 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPC5P78333 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPC5P78333 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPC5P78333 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPC5P78333 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPC5P78333 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GPC5P78333 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPC5P78333 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPC5P78333 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPC5P78333 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPC5P78333 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPC5P78333 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPC5P78333 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPC5P78333 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPC5P78333 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPC5P78333 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPC5P78333 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPC5P78333 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC5P78333 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC5P78333 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC5P78333 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC5P78333 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPC5P78333 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPC5P78333 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPC5P78333 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GPC5P78333 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPC5P78333 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPC5P78333 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GPC5P78333 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPC5P78333 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPC5P78333 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPC5P78333 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPC5P78333 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GPC5P78333 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC5P78333 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC5P78333 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPC5P78333 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPC5P78333 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPC5P78333 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPC5P78333 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPC5P78333 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPC5P78333 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPC5P78333 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
GPC5P78333 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPC5P78333 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPC5P78333 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPC5P78333 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPC5P78333 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPC5P78333 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPC5P78333 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPC5P78333 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC5P78333 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC5P78333 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC5P78333 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC5P78333 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPC5P78333 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC5P78333 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC5P78333 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC5P78333 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC5P78333 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC5P78333 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC5P78333 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC5P78333 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC5P78333 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GPC5P78333 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC5P78333 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC5P78333 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC5P78333 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC5P78333 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC5P78333 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC5P78333 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC5P78333 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC5P78333 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC5P78333 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPC5P78333 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPC5P78333 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC5P78333 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC5P78333 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC5P78333 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC5P78333 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC5P78333 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC5P78333 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC5P78333 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC5P78333 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC5P78333 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC5P78333 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC5P78333 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms