Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS25P62851 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS25P62851 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS25P62851 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS25P62851 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS25P62851 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS25P62851 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS25P62851 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS25P62851 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS25P62851 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS25P62851 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS25P62851 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS25P62851 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS25P62851 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS25P62851 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS25P62851 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS25P62851 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS25P62851 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS25P62851 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS25P62851 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS25P62851 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS25P62851 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS25P62851 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS25P62851 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS25P62851 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS25P62851 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS25P62851 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS25P62851 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS25P62851 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS25P62851 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS25P62851 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS25P62851 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS25P62851 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS25P62851 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS25P62851 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS25P62851 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS25P62851 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS25P62851 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS25P62851 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS25P62851 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS25P62851 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS25P62851 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS25P62851 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS25P62851 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS25P62851 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS25P62851 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS25P62851 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS25P62851 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS25P62851 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS25P62851 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS25P62851 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS25P62851 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS25P62851 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS25P62851 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS25P62851 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS25P62851 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS25P62851 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS25P62851 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS25P62851 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS25P62851 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS25P62851 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS25P62851 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS25P62851 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS25P62851 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS25P62851 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS25P62851 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS25P62851 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS25P62851 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS25P62851 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS25P62851 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS25P62851 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS25P62851 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS25P62851 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS25P62851 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS25P62851 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS25P62851 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS25P62851 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS25P62851 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS25P62851 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS25P62851 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS25P62851 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS25P62851 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS25P62851 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS25P62851 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS25P62851 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS25P62851 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS25P62851 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS25P62851 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS25P62851 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS25P62851 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS25P62851 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS25P62851 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS25P62851 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS25P62851 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS25P62851 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS25P62851 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS25P62851 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS25P62851 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS25P62851 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS25P62851 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms