Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HERVK_113P62684 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HERVK_113P62684 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HERVK_113P62684 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HERVK_113P62684 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HERVK_113P62684 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HERVK_113P62684 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HERVK_113P62684 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HERVK_113P62684 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HERVK_113P62684 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HERVK_113P62684 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HERVK_113P62684 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HERVK_113P62684 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HERVK_113P62684 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HERVK_113P62684 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HERVK_113P62684 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HERVK_113P62684 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HERVK_113P62684 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HERVK_113P62684 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HERVK_113P62684 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HERVK_113P62684 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HERVK_113P62684 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HERVK_113P62684 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HERVK_113P62684 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HERVK_113P62684 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
HERVK_113P62684 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HERVK_113P62684 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HERVK_113P62684 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HERVK_113P62684 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HERVK_113P62684 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HERVK_113P62684 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HERVK_113P62684 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms