Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS3AP61247 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS3AP61247 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS3AP61247 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS3AP61247 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS3AP61247 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS3AP61247 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms