Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2AP61019 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2AP61019 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB2AP61019 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB2AP61019 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB2AP61019 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB2AP61019 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms