Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTXN1P60606 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTXN1P60606 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTXN1P60606 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTXN1P60606 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTXN1P60606 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTXN1P60606 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTXN1P60606 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTXN1P60606 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTXN1P60606 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN1P60606 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN1P60606 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN1P60606 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTXN1P60606 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTXN1P60606 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms