Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERVFRD-1P60508 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVFRD-1P60508 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVFRD-1P60508 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFRD-1P60508 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFRD-1P60508 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms