Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP12AP54707 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP12AP54707 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP12AP54707 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP12AP54707 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP12AP54707 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms