Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATXN1P54253 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATXN1P54253 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATXN1P54253 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATXN1P54253 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATXN1P54253 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATXN1P54253 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATXN1P54253 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATXN1P54253 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATXN1P54253 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATXN1P54253 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATXN1P54253 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATXN1P54253 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN1P54253 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN1P54253 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN1P54253 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN1P54253 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATXN1P54253 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATXN1P54253 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATXN1P54253 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATXN1P54253 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATXN1P54253 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATXN1P54253 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATXN1P54253 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATXN1P54253 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATXN1P54253 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ATXN1P54253 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATXN1P54253 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATXN1P54253 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATXN1P54253 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATXN1P54253 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATXN1P54253 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATXN1P54253 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATXN1P54253 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATXN1P54253 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms