Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRISP1P54107 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CRISP1P54107 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRISP1P54107 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRISP1P54107 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRISP1P54107 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRISP1P54107 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CRISP1P54107 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRISP1P54107 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRISP1P54107 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRISP1P54107 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRISP1P54107 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRISP1P54107 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRISP1P54107 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRISP1P54107 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRISP1P54107 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRISP1P54107 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRISP1P54107 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRISP1P54107 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms