Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLNS1AP54105 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLNS1AP54105 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLNS1AP54105 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLNS1AP54105 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLNS1AP54105 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms